A univocal definition of the neuronal soma morphology using Gaussian mixture models

Luengo Sánchez, Sergio; Bielza Lozoya, María Concepción; Benavides Piccione, Ruth; Fernaud Espinosa, Isabel; Felipe Oroquieta, Javier de y Larrañaga Múgica, Pedro María (2015). A univocal definition of the neuronal soma morphology using Gaussian mixture models. "Frontiers in Neuroanatomy", v. 9 ; pp. 1-11. ISSN 1662-5129. https://doi.org/10.3389/fnana.2015.00137.

Descripción

Título: A univocal definition of the neuronal soma morphology using Gaussian mixture models
Autor/es:
  • Luengo Sánchez, Sergio
  • Bielza Lozoya, María Concepción
  • Benavides Piccione, Ruth
  • Fernaud Espinosa, Isabel
  • Felipe Oroquieta, Javier de
  • Larrañaga Múgica, Pedro María
Tipo de Documento: Artículo
Título de Revista/Publicación: Frontiers in Neuroanatomy
Fecha: Noviembre 2015
Volumen: 9
Materias:
Palabras Clave Informales: Three-dimensional soma reconstruction; Repair and segmentation; Morphology validation; Mesh comparison; Gaussian mixture model
Escuela: E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM)
Departamento: Inteligencia Artificial
Licencias Creative Commons: Reconocimiento - Sin obra derivada - No comercial

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Resumen

The definition of the soma is fuzzy, as there is no clear line demarcating the soma of the labeled neurons and the origin of the dendrites and axon. Thus, the morphometric analysis of the neuronal soma is highly subjective. In this paper, we provide a mathematical definition and an automatic segmentation method to delimit the neuronal soma. We applied this method to the characterization of pyramidal cells, which are the most abundant neurons in the cerebral cortex. Since there are no benchmarks with which to compare the proposed procedure, we validated the goodness of this automatic segmentation method against manual segmentation by neuroanatomists to set up a framework for comparison. We concluded that there were no significant differences between automatically and manually segmented somata, i.e., the proposed procedure segments the neurons similarly to how a neuroanatomist does. It also provides univocal, justifiable and objective cutoffs. Thus, this study is a means of characterizing pyramidal neurons in order to objectively compare the morphometry of the somata of these neurons in different cortical areas and species.

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TipoCódigoAcrónimoResponsableTítulo
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Más información

ID de Registro: 41015
Identificador DC: http://oa.upm.es/41015/
Identificador OAI: oai:oa.upm.es:41015
Identificador DOI: 10.3389/fnana.2015.00137
URL Oficial: http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fnana.2015.00137/full
Depositado por: Memoria Investigacion
Depositado el: 10 Ene 2017 10:10
Ultima Modificación: 10 Ene 2017 10:10
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