Diseño y desarrollo de la interfaz web de un lenguaje de programación para la automatización de protocolos biológicos

Verastegui Alegre, Renzo André (2015). Diseño y desarrollo de la interfaz web de un lenguaje de programación para la automatización de protocolos biológicos. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Description

Title: Diseño y desarrollo de la interfaz web de un lenguaje de programación para la automatización de protocolos biológicos
Author/s:
  • Verastegui Alegre, Renzo André
Contributor/s:
  • Rodríguez-Patón Aradas, Alfonso
Item Type: Final Project
Degree: Grado en Ingeniería Informática
Date: January 2015
Subjects:
Faculty: E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM)
Department: Inteligencia Artificial
Creative Commons Licenses: Recognition - No derivative works - Non commercial

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Abstract

En el presente Trabajo fin de Grado, se desarrolla una interfaz para para la automatización de experimentos biológicos en dispositivos microfluídicos. Muchas veces las descripciones textuales de los experimentos realizados por los biólogos no son completas y ocasionalmente son ambiguas. Esto impide que se pueda automatizar su ejecución y que la replicación de experimentos biológicos sea difícil entre diferentes laboratorios. Es por ello, que la definición de un lenguaje de programación para la especificación de experimentos biológicos sea de gran interés. Se pueden reducir errores y disminuir el tiempo de ejecución de los protocolos al poder automatizarse su ejecución. Además, la descripción de un experimento biológico en un lenguaje de programación eliminar toda posible ambigüedad. El lenguaje de programación debe ser de alto nivel para que los biólogos no tengan dificultad en su aprendizaje y a la vez, abstraer/ocultar los aspectos relativos al hardware fluídico sobre el que se van a ejecutar los experimentos. La interfaz del lenguaje ayudará a los biólogos, ya que ellos no conocen bien los sistemas microfluídicos ni su programación, para que así solamente se centren en diseñar el experimento y en sacar conclusiones sobre el mismo. Para este Trabajo fin de grado ha sido necesario el estudio de campos interdisciplinares como la evolución dirigida de moléculas, los sistemas microfluídicos, la bio-estandarización y la automatización de protocolos biológicos. El desarrollo de la interfaz constará de dos fases, la primera donde se realizará el diseño y la segunda donde se implementará el diseño.---ABSTRACT---In this Final-Year-Project, an interface for generating a code for automation of biological experiments in microfluidic devices is developed. Often the textual descriptions of experiments conducted by biologists are not complete and are occasionally ambiguous. This makes difficult to automate their implementation and the replication of biological experiments between different laboratories. For these reasons the definition of a programming language for specifying biological experiments is of great interest. Reduce errors and decrease the runtime of the protocols can be done if the execution is automated. Moreover, the description of a biological experiment in a programming language eliminates any ambiguity. The programming language should be high level, so that biologists have no difficulty in learning and simultaneously, abstracting / hide aspects of the fluidic hardware that will be carried out the experiments. The interface of the language will help biologists because they are not familiar with microfluidic systems or programming, so that they focus on designing the experiment and draw conclusions on it. For this Final-Year-Project has been necessary to study fields such as directed evolution of molecules, microfluidic systems, bio-standardization and automation of biological protocols. The development of the interface will consist of two phases, the first one is the phase of the design of the interface and the second one is when design is implemented.

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Item ID: 47759
DC Identifier: http://oa.upm.es/47759/
OAI Identifier: oai:oa.upm.es:47759
Deposited by: Biblioteca Facultad de Informatica
Deposited on: 14 Sep 2017 11:42
Last Modified: 14 Sep 2017 11:42
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