Implementación del algoritmo SLICO en EspIN

Muñoz Fernández, Álvaro (2018). Implementación del algoritmo SLICO en EspIN. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Description

Title: Implementación del algoritmo SLICO en EspIN
Author/s:
  • Muñoz Fernández, Álvaro
Contributor/s:
  • Toharia Rabasco, Pablo
  • Pozas Álvarez, Félix de las
Item Type: Final Project
Degree: Grado en Ingeniería Informática
Date: July 2018
Subjects:
Faculty: E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM)
Department: Arquitectura y Tecnología de Sistemas Informáticos
Creative Commons Licenses: Recognition - No derivative works - Non commercial

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Abstract

EspINA[1] es una herramienta de código libre que realiza tareas de segmentación, análisis y visualización de modelos volumétricos a partir de imágenes tridimensionales (stacks) obtenidas por microscopios electrónicos y confocales, y empleada por neurólogos para el estudio de las neuronas y sus componentes. Para ello emplea un abanico de algoritmos de tratamiento de imágenes al que se quiere añadir el algoritmo SLIC[2] (Simple Linear Iterative Clustering), y sus variantes SLICO (Zero-parameter) y ASLIC (Adaptive). El desarrollo de este proyecto corresponde a la adaptación de dicho algoritmo a las necesidades de EspINA y su implementación e integración en la herramienta. Se describirán los pasos realizados para cumplir los objetivos propuestos y se analizarán los resultados obtenidos en el proceso. También se reflejará la toma de decisiones y las justificaciones para elegir el algoritmo SLIC, y se comparará con otros algoritmos similares que se encuentren publicados.---ABSTRACT---EspINA[1] is an open-source tool used for the segmentation, analysis and rendering of volumetric images (stacks) retrieved by electronic microscopes. It is used by neuroscientists as a tool to study neurons and their composition. This tool makes use of a wide range of algorithms which SLIC (Simple Linear Iterative Clustering) is to be added to that list along with its variants: SLICO (Zero-parameter) and ASLIC (Adaptive). In this final project the SLIC algorithm will be adapted to the needs of EspINA and it will be implemented and integrated into the tool. The document will walk through the steps taken to achieve the proposed goals and will highlight the achieved results. It will also go through the decission-making and explain why SLIC was chosen instead of similar published algorithms.

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Item ID: 52471
DC Identifier: http://oa.upm.es/52471/
OAI Identifier: oai:oa.upm.es:52471
Deposited by: Biblioteca Facultad de Informatica
Deposited on: 02 Oct 2018 08:55
Last Modified: 02 Oct 2018 08:55
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