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Thesis

Gregorio Godoy, Paula (2018). Modelling bacterial ecological strategies using an individual-based simulator. Thesis (Doctoral), E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM). https://doi.org/10.20868/UPM.thesis.52613.

Gutiérrez Pescarmona, Martín Eduardo (2017). A new agent-based platform for simulating multicellular biocircuits with conjugative plasmids. Thesis (Doctoral), E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM). https://doi.org/10.20868/UPM.thesis.48812.

Gupta, Vishal (2017). An end-to-end solution for automation of biological protocols. Thesis (Doctoral), E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM). https://doi.org/10.20868/UPM.thesis.48791.

Prestes García, Antonio (2017). Modeling and analyzing the kinetic of conjugative plasmids. Thesis (Doctoral), E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM). https://doi.org/10.20868/UPM.thesis.48793.

Pérez Pérez, David (2016). Computación celular con membranas: un estudio de modelos de cómputo bioinspirados. Thesis (Doctoral), E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM). https://doi.org/10.20868/UPM.thesis.39518.

Serrano Sebastián, Irene (2015). Diseño y desarrollo de un modelo booleano probabilístico de regulación genética en el simulador de colonias bacterianas GRO. Thesis (Master thesis), E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM).

Arroyo García, Aurora Sofía (2013). Enhancing iDynoMiCS framework with a plasmid conjugation module. Thesis (Master thesis), E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM).

Sainz de Murieta Fuentes, Iñaki (2013). Inference Models in DNA Computing. Thesis (Doctoral), Facultad de Informática (UPM).

Miró Bueno, Jesús María (2012). Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models. Thesis (Doctoral), Facultad de Informática (UPM).

Prestes Garcia, Antonio (2011). A first approach to individual-based modeling of the bacterial conjugation dynamics. Thesis (Master thesis), Facultad de Informática (UPM).

Sainz de Murieta Fuentes, Iñaki (2011). Modelos de computación lógica con ADN. Thesis (Master thesis), Facultad de Informática (UPM).

Pardilla Mata, Diego (2011). Estudio de protocolos de comunicación bacterianos: conjugación y quorum sensing.. Thesis (Master thesis), Facultad de Informática (UPM).

Martínez Luaces, Milton (2008). La Conciencia: Modelado de sus funciones cognitivas para entidades artificiales mediante redes neuronales modulares. Thesis (Doctoral), Facultad de Informática (UPM).

Final Project

García Blanco, Alejandro (2019). Diseño y desarrollo de una herramienta de programación de laboratorios de biología portátiles: Bioblocks 3.0. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Amrán Beniflah, David (2019). Desarrollo en JavaScript de una interfaz visual e interactiva para la especificación de experimentos biológicos. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Alonso Merino, Carolina (2018). Programación del crecimiento de bacterias E.coli en el simulador BactoSIM. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Velasco Matesanz, Javier (2018). Traduccuón de experimentos biológicos: de BIOblocks a código Arduino. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Moreno Bendala, Fernando (2018). Traductor de especificación de experimentos para el simulador multicelular Gro. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Moya López, Aitor (2018). Desarrollo de una plataforma web para la especificación de protocolos biológicos basados en BIOBLOCKS. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Martínez García, Enrique (2018). Traductor de especificación de experimentos en YAML para el simulador multicelular GRO. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Galán Berasaluce, David (2017). Desarrollo de una plataforma web de simulación de biocircuitos. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Catalán Valbuena, Marco (2017). Nuevo lenguaje de especificación de experimentos para el simulador GRO. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Sáez Raspeño, Sandra (2015). Diseño e implementación de un módulo de crecimiento bacteriano dependiente de nutrientes en el simulador GRO. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Sotodosos Rodrigo, Iván (2015). Desarrollo de una aplicación web orientada a la asistencia en el diseño de protocolos de biología sintética. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

García Herrera, Bernardo (2015). Desarrollo de una plataforma de biología bajo demanda. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

González Muñoz, Sergio (2015). Desarrollo de una plataforma de gestión de un laboratorio automatizado. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Verastegui Alegre, Renzo André (2015). Diseño y desarrollo de la interfaz web de un lenguaje de programación para la automatización de protocolos biológicos. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Muñoz Martín, Luis Enrique (2014). Nuevo algoritmo de relajación para motores de cuerpos sólidos. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Serrano Sebastián, Irene (2014). Programación y simulación de la comunicación intercelular mediante conjugación en el simulador multicelular GRO. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Pumar García, César (2013). Simulación de evolución dirigida de bacteriófagos en poblaciones de bacterias en 2D. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, Facultad de Informática (UPM), Madrid, España.

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