Generación automática de un índice de recursos bioinformáticos a partir de la literatura científica

Abstract

En los últimos años se ha producido un aumento en el número de recursos bioinformáticos de carácter público accesibles a través de Internet. Éstos proporcionan diversas herramientas y bases de datos a la comunidad científica, facilitando así las diferentes tareas que surgen durante la investigación biomédica. Como ejemplo, estas tareas incluyen búsquedas en bases de datos, alineamiento y búsqueda de secuencias genéticas, anotación y visualización de proteínas, etc. La evolución en la representación de datos biológicos y en la implementación de herramientas para el análisis y almacenamiento de los mismos ha dado como resultado la proliferación de numerosos estándares de representación e interfaces de análisis y procesamiento. La complejidad a la hora de recuperar la información proporcionada por estos datos y navegar por distintas redes para su análisis constituye un “cuello de botella” para los bioinformáticos y una barrera para los investigadores que no poseen una formación en el campo de la informática. Llegados a este punto, la integración de todos los datos y herramientas bioinformáticas existentes es vital, pero no ha empezado a ser tratada de manera exhaustiva hasta los últimos años.