Evaluación y mejora de una herramienta open source para la representación de la conectividad funcional del cerebro mediante el uso de imágenes MEG Y MRI

Abstract

This project is aimed at finding an application that allows to obtain the functional connectivity of the brain through the use of MRI and MEG images; and then, to be able to provide a tool that improves some aspe ct of this application. The chosen application is called BrainStorm, and the aspect to improve is the way in which this application has to represent the matrix of correlations obtained by calculating the functional connectivity between different regions o f the brain ( scout s in BrainStorm). For the elaboration of this tool we have based on the use of the D3.js library of JavaScript, which offers us many facilities to be able to represent the correlation matrix. BrainStorm is an application that runs throu gh MATLAB , so the data that we want to represent with JavaScript are contained in MATLAB objects. So in our tool we have implemented scripts in Python, Batch, and JavaScript until we reach its final representation in a DashBoard implemented in HTML. Final ly, it has been possible to implement a tool that is able to represent dynamic and interactive visualizations that allows to the user that uses it to analyze the functional connectivity of the brain from the matrix of correlation obtained from MATLAB throu gh BrainStorm.---RESUMEN---El objetivo de este proyecto es encontrar una aplicación que permita obtener la conectividad funcional del cerebro a través del uso de imágenes MRI y MEG; y luego, poder proporcionar una herramienta que mejore algún aspecto de esta aplicación. La aplicación elegida se llama BrainStorm, y el aspecto a mejorar es la forma en que esta aplicación tiene de repres entar la matriz de correlaci ón o btenida al calcular la conectividad funcional entre las diferentes regiones del cerebro (explo radores en BrainStorm). Para la elaboración de esta herramienta, nos basamos en el uso de la biblio teca D3.js de JavaScript, que ofrece numerosas funciones para poder repres entar la matriz de correlación . BrainStorm es una aplicación que se ejecuta a travé s de MATLAB, por lo que los datos que se desean representar con JavaScript están contenidos en objetos MATLAB. Por eso, en nuestra herramienta, se han implementado scripts en Python, Batch y JavaScript hasta que se llega a la representación final en un D ashBoard implementado en HTML. Finalmente, ha sido posible implementar una herramienta capaz de representar visualizaciones dinámicas e interactivas que permite al usuario que lo utiliza analizar la conectividad funcional del cerebro desde la matriz de co rrelación obtenida de Brainstorm.