Características sistémicas del ecosistema de herramientas Web que dan soporte a la investigación en Biología Molecular

Abstract

Los programas de ordenador y servidores web tienen un gran peso en los estudios de biología molecular en la actualidad. La desaparición de estos recursos informáticos supone un problema en el campo científico debido a que afecta a la reproducibilidad de los artículos que los utilicen. En este trabajo de fin de grado analizamos los tiempos de supervivencia de programas y servidores Web usando datos de más de 6000 publicaciones de las revistas Bioinformatics y Nucleic Acid Research. La obtención de las publicaciones se desarrolla a través de una extracción automática de datos de las direcciones web de las revistas. Además, se aplicaron filtros para la extracción de los campos de información deseados. Posteriormente se hizo un análisis de supervivencia con los métodos de Kaplan-Meier y Turnbull de los datos. Para ello fue necesario adaptar los datos, lo cual implicaba el filtrado de estos según sus fechas de muerte. El análisis de supervivencia se hizo respecto a 2 factores: la revista en la que se publicaron los artículos, y el número de artículos que citan al artículo de interés. Se desarrolló este análisis para saber si estos dos factores influían al tiempo de supervivencia de las herramientas bioinformáticas asociadas a los artículos estudiados. Para comprobar si las revistas y citaciones suponían una diferencia en los tiempos de supervivencia, se desarrolló un test de comparación de hipótesis, el test log-rank. Para terminar, se estudió el patrón temporal de las citaciones durante la vida de los recursos informáticos para observar si la popularidad de la herramienta puede ser un medidor de muerte de estos recursos.