An Automatic Quantification and Registration Strategy to Create a Gene Expression Atlas of Zebrafish Embryogenesis

Castro González, Carlos; Luengo Oroz, Miguel Ángel; Fernández de Manuel, Laura; Ledesma Carbayo, María Jesús; Santos Lleo, Andres de; Desnoulez, Sophie; Duloquin, Louise; Montagna, Sara; Bourgine, Paul y Peyrieras, Nadine (2009). An Automatic Quantification and Registration Strategy to Create a Gene Expression Atlas of Zebrafish Embryogenesis. En: "31st Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC 2009)", 02/06/2009 - 06/06/2009, Minneapolis MN USA. pp. 1469-1472. https://doi.org/10.1109/IEMBS.2009.5332436.

Descripción

Título: An Automatic Quantification and Registration Strategy to Create a Gene Expression Atlas of Zebrafish Embryogenesis
Autor/es:
  • Castro González, Carlos
  • Luengo Oroz, Miguel Ángel
  • Fernández de Manuel, Laura
  • Ledesma Carbayo, María Jesús
  • Santos Lleo, Andres de
  • Desnoulez, Sophie
  • Duloquin, Louise
  • Montagna, Sara
  • Bourgine, Paul
  • Peyrieras, Nadine
Tipo de Documento: Ponencia en Congreso o Jornada (Artículo)
Título del Evento: 31st Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC 2009)
Fechas del Evento: 02/06/2009 - 06/06/2009
Lugar del Evento: Minneapolis MN USA
Título del Libro: Proceedings of Engineering in Medicine and Biology Society, 2009. EMBC 2009. Annual International Conference of the IEEE
Fecha: 2009
Materias:
Escuela: E.T.S.I. Telecomunicación (UPM)
Departamento: Ingeniería Electrónica
Licencias Creative Commons: Reconocimiento - Sin obra derivada - No comercial

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Resumen

In order to properly understand and model the gene regulatory networks in animals development, it is crucial to obtain detailed measurements, both in time and space, about their gene expression domains. In this paper, we propose a complete computational framework to fulfill this task and create a 3D Atlas of the early zebrafish embryogenesis annotated with both the cellular localizations and the level of expression of different genes at different developmental stages. The strategy to construct such an Atlas is described here with the expression pattern of 5 different genes at 6 hours of development post fertilization.

Más información

ID de Registro: 13889
Identificador DC: http://oa.upm.es/13889/
Identificador OAI: oai:oa.upm.es:13889
Identificador DOI: 10.1109/IEMBS.2009.5332436
Depositado por: Memoria Investigacion
Depositado el: 25 Feb 2013 08:23
Ultima Modificación: 21 Abr 2016 13:19
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