Mejora de la segmentación de espinas en imágenes de microscopía confocal

Resumen

La reconstrucción y caracterización de las espinas dendríticas es hoy en día un
área de trabajo de gran interés en la investigación neurobiológica. Las dendritas
son prolongaciones en forma de ramas de la neurona. Las espinas dendríticas se
encuentran a lo largo de las dendritas y son las encargadas de transmitir los impulsos
electroquímicos al cuerpo de la neurona.
El objetivo de este trabajo es desarrollar un algoritmo con el objetivo de mejorar
las reconstrucciones 3D de las espinas dendríticas. Se ha utilizado un algoritmo de
segmentación basado en los contornos activos morfológicos para analizar las imágenes
de partida y conseguir nuevas reconstrucciones 3D fieles a estas imágenes. En este
documento presentamos todo el desarrollo necesario para llevar a cabo los objetivos
del proyecto. Por último también se presentarán los resultados obtenidos con este
método comparándolo con las reconstrucciones de partida.
ABSTRACT
The reconstruction and characterization of dendritic spines is a hot topic in modern
neurobiology research. Dendrites are the branched ramifications of a neuron.
Dendritic spines are found along the dendrites and are responsible for transmitting
electrochemical signals to the neuron’s main body.
The purpose of this work is to develop an algorithm to improve the 3D reconstruction
of dendritic spines. We use a segmentation algorithm based on morphological active
contours to analyze the images and get new faithful 3D reconstructions of these
images. In this document we present all the development necessary to accomplish
the project goals. Finally, we will compare present results obtained by this method
with the starting reconstructions.