An efficient implementation of the synchronization likelihood algorithm for functional connectivity

Rosales García, Francisco Javier; García Dopico, Antonio; Bajo Breton, Ricardo y Nevado, Angel (2014). An efficient implementation of the synchronization likelihood algorithm for functional connectivity. "Neuroinformatics", v. 2 (n. 13); pp. 1-14. ISSN 1539-2791. https://doi.org/10.1007/s12021-014-9251-4.

Descripción

Título: An efficient implementation of the synchronization likelihood algorithm for functional connectivity
Autor/es:
  • Rosales García, Francisco Javier
  • García Dopico, Antonio
  • Bajo Breton, Ricardo
  • Nevado, Angel
Tipo de Documento: Artículo
Título de Revista/Publicación: Neuroinformatics
Fecha: Diciembre 2014
Volumen: 2
Materias:
Palabras Clave Informales: Functional connectivity, Synchronization likelihood, Implementation, Parallelization
Escuela: Centro de Tecnología Biomédica (CTB) (UPM)
Departamento: Tecnología Fotónica y Bioingeniería
Licencias Creative Commons: Reconocimiento - Sin obra derivada - No comercial

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Resumen

Measures of functional connectivity are commonly employed in neuroimaging research. Among the most popular measures is the Synchronization Likelihood which provides a non-linear estimate of the statistical dependencies between the activity time courses of different brain areas. One aspect which has limited a wider use of this algorithm is the fact that it is very computationally and memory demanding. In the present work we propose new implementations and parallelizations of the Synchronization Likelihood algorithm with significantly better performance both in time and in memory use. As a result both the amount of required computational time is reduced by 3 orders of magnitude and the amount of memory needed for calculations is reduced by 2 orders of magnitude. This allows performing analyses that were not feasible before from a computational standpoint.

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TipoCódigoAcrónimoResponsableTítulo
Gobierno de EspañaTEC2012-38453-C04Sin especificarSin especificarSin especificar

Más información

ID de Registro: 35703
Identificador DC: http://oa.upm.es/35703/
Identificador OAI: oai:oa.upm.es:35703
Identificador DOI: 10.1007/s12021-014-9251-4
URL Oficial: https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs12021-014-9251-4
Depositado por: Memoria Investigacion
Depositado el: 07 May 2017 08:15
Ultima Modificación: 07 May 2017 08:15
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