Desarrollo de una aplicación para la exploración interactiva de datos neurocientíficos

Martín Calvo, Borja (2016). Desarrollo de una aplicación para la exploración interactiva de datos neurocientíficos. Proyecto Fin de Carrera / Trabajo Fin de Grado, E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM), Madrid, España.

Descripción

Título: Desarrollo de una aplicación para la exploración interactiva de datos neurocientíficos
Autor/es:
  • Martín Calvo, Borja
Director/es:
  • Rodríguez Martínez de Bartolomé, Ángel
Tipo de Documento: Proyecto Fin de Carrera/Grado
Grado: Grado en Ingeniería Informática
Fecha: Junio 2016
Materias:
Escuela: E.T.S. de Ingenieros Informáticos (UPM)
Departamento: Arquitectura y Tecnología de Sistemas Informáticos
Licencias Creative Commons: Reconocimiento - Sin obra derivada - No comercial

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Resumen

Este Trabajo de fin de grado se enmarca dentro del ámbito de la neuroinformática, concretamente en el campo de la interacción persona-computador aplicada a la neurociencia. El trabajo realizado durante este proyecto es parte del Proyecto Cajal Blue Brain, que pretende realizar la reconstrucción de una columna cortical del cerebro humano para avanzar en la comprensión de su funcionamiento así como en el estudio de sus disfunciones. Los más recientes avances en la tecnología de obtención de las imágenes de microscopía han incrementado la cantidad y complejidad de los datos para su análisis. Esto ha provocado que se deban desarrollar nuevas herramientas que faciliten el manejo de estos datos. Durante el año 2013 se desarrolló una aplicación de escritorio multiplataforma que desarrollaba nuevas técnicas interactivas para el análisis de imágenes, mejorando la comprensión de los datos por medio de la interacción con las representaciones derivadas de los datos originales. En la época en la que vivimos, Internet se presenta en la mayoría de aspectos de nuestra vida, es por ello que se ha decidido renovar esta aplicación, aprovechando así las nuevas herramientas que han ido surgiendo en estos años y que nos ofrecen una amplia variedad de posibilidades para implementar mejoras y facilitar la resolución de futuras necesidades que vayan surgiendo. En este Trabajo se ha realizado la actualización de esta versión de escritorio aprovechando los recursos que nos ofrece el ámbito web, migrando así el código a las nuevas tecnologías web para desarrollar la aplicación en esta nueva plataforma. Durante la realización del trabajo se han diferenciado líneas de desarrollo: una primera parte encargada de mejorar la visualización de las imágenes tomadas mediante técnicas de microscopía electrónica; una segunda parte centrada en la interacción con los datos; y finalmente, una tercera para ofrecer una interfaz común permitiendo la posibilidad de interacción coordinada y simultánea entre las imágenes y los datos para mejorar su análisis. Con esta nueva versión se ha conseguido una aplicación más veloz y más ligera que permite ser utilizada en mayor número de equipos sin instalaciones previas de programas adicionales favoreciendo su difusión y uso por parte de los neurocientificos.---ABSTRACT---This work is defined within the Neuroinformatics, specifically in the field of computer-human interaction applied to Neuroscience. The work carried out during this project is part of the Cajal Blue Brain Project, which aims to reconstruct a microcolumn of the human brain cortex in order to make advances in the comprehension of its functions as well as in the studies of its disseases. The most recent advances in image acquisition technology have increased the amount and complexity of data for analysis tasks. This fact has caused that we should develop new tools to facilitate the data management in these analysis. In year 2013, a multiplatform desktop application was developed to provide new interactive techniques for data analysis and to improve the exploration by interacting with new representations derived from the original data. In this age, Internet has become increasingly important in our lives, consequently we have decided to update this application, taking advantage of the new tools that have emerged in the last years and it offers a wide variety of possibilities to implement improvements and make easier the resolution of future needs. In this work, this old application has been updated by the new web resources available nowadays and we have migrated the code to develop the new web application. During the development work I have differentiated three main components: one module is responsible for improving the visualization of pictures taken by electronic microscopy, another component is focused in interaction issues with the available data, and finally the third part will be a common interface to offer the possibility of synchronizing and coordinating the interaction between images and data in orderto improve the analysis. This new version is faster than the original one has less external dependencies that allow its use in most computers without previous installations of additional programs. This favors its distribution among neuroscientists.

Más información

ID de Registro: 43498
Identificador DC: http://oa.upm.es/43498/
Identificador OAI: oai:oa.upm.es:43498
Depositado por: Biblioteca Facultad de Informatica
Depositado el: 10 Oct 2016 07:46
Ultima Modificación: 10 Oct 2016 07:46
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