Drug repurposing approaches and validation through DISNET data

Resumen

El reposicionamiento de fármacos se define como el proceso de encontrar nuevos usos para fármacos ya existentes. Se ha convertido en una alternativa interesante al desarrollo de fármacos de novo porque reduce los costes, los riesgos y los tiempos. Los enfoques se dividen en in vitro e in silico. Los métodos computacionales de reposicionamiento de fármacos hacen uso de los datos biomédicos actuales para identificar nuevas indicaciones para fármacos ya aprobados. En este contexto se sitúa el proyecto DISNET, financiado con la subvención “RTI2018-094576-A-I00” del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades de España. Su objetivo es construir una compleja red multicapa que incorpora el conocimiento biomédico de enfermedades extraído de fuentes públicas textuales y estructuradas, incluyendo (pero sin limitarse a) datos relativos a las enfermedades, los síntomas relacionados, los genes, los fármacos, las dianas farmacológicas, etc. Su objetivo final es generar posibles hipótesis de reposicionamiento de fármacos. En el presente trabajo se incluye una revisión del concepto de reposicionamiento de fármacos y de sus enfoques. Además, se describen las actualizaciones introducidas en términos de estructura y contenido en la base de datos de DISNET para mejorar su eficiencia. Por último, pero no menos importante, se detalla un análisis de validación para demostrar la capacidad de DISNET para encontrar fármacos candidatos a reposicionamiento. Se ha recogido de la literatura una colección de casos conocidos de fármacos reposicionados con éxito y se han estudiado sus diferencias estadísticas con respecto a otros datos biomédicos no necesariamente relacionados con eventos de reposicionamiento. Toda la información utilizada se ha obtenido de la base de conocimientos DISNET. Posteriormente, hemos realizado tres análisis desde tres puntos de vista: genes, síntomas y categorías. Con ellos se pretende concluir que existe una disimilitud estadísticamente significativa entre los datos relacionados con la reutilización de fármacos y los no relacionados. Los resultados obtenidos servirán de base a la hora de generar hipótesis de reposicionamiento. De esta manera, DISNET se valida como una herramienta potente para el reposicionamiento de medicamentos.